Facultad de Artes

• Magíster en Artes, mención Composición Musical
• Magíster en Artes, mención Musicología
• Magíster en Artes, mención Teoría e Historia del Arte

Facultad de Ciencias

• Magíster en Ciencias Matemáticas

Facultad de Ciencias Agronómicas

• Magíster en Ciencias Agropecuarias, mención en Producción Agroindustrial
• Magíster en Ciencias Agropecuarias, mención en Producción Animal
• Magíster en Ciencias Agropecuarias, mención en Producción de Cultivos
• Magíster en Ciencias Agropecuarias, mención en Producción Frutícola

Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas

• Magíster en Ciencias de la Ingeniería, mención Ingeniería Geotécnica
• Magíster en Ciencias de la Ingeniería, mención Ingeniería Sísmica
• Magíster en Ciencias de la Ingeniería, mención Recursos y Medio Ambiente Hídrico
• Magíster en Ciencias de la Ingeniería, mención en Mecánica
• Magíster en Ciencias de la Ingeniería, mención en Eléctrica
• Magíster en Ciencias de la Ingeniería, mención en Metalurgia Extractiva
• Magíster en Ciencias de la Ingeniería, mención en Transporte
• Magíster en Ciencias, mención Astronomía
• Magíster en Ciencias, mención en Computación
• Magíster en Ciencias, mención en Física
• Magíster en Ciencias, mención en Geofísica
• Magíster en Ciencias, mención en Geología
• Magíster en Economía Aplicada
• Magíster en Gestión de Operaciones
• Magíster en Gestión y Dirección de Empresas (MBA)
• Magíster en Gestión y Políticas Públicas
• Magíster en Ingeniería de Negocios con Tecnologías de Información
• Magíster en Meteorología y Climatología
• Magíster en Minería
• Magíster en Gestión y Políticas Públicas
• Magíster en Tecnologías de Información

Facultad de Ciencias Forestales

• Magíster en Áreas Silvestres y Conservación de la Naturaleza

Facultad de Ciencias Sociales

• Magister en Análisis Sistémico Aplicado a la Sociedad 
• Magíster en Ciencias Sociales, mención Sociología de la Modernización
• Magíster en Educación, mención en Currículo y Comunidad Educativa
• Magíster en Educación, mención en Informática Educativa
• Magíster en Psicología, mención en Psicología Comunitaria

Facultad de Derecho

• Magíster en Derecho con menciones en: Derecho Económico, Derecho Internacional, Derecho privado, Derecho Público y Ciencias del Derecho

Facultad de Economía y Negocios

• Magíster en Economía

Facultad de Filosofía y Humanidades

• Magíster en Estudios Latinoamericanos
• Magíster en Filosofía
• Magíster en Historia
• Magíster en Lingüística, mención Lengua Española
• Magíster en Lingüística, Mención Lengua Inglesa
• Magíster en Literatura

Facultad de Medicina

• Magíster en Salud Pública
• Magíster en Bioestadística
• Magíster en Bioética

Facultad de Odontología

• Magíster en Ciencias Odontológicas, mención Periodontología

Instituto de Nutrición y Tecnología de los Alimentos

• Magíster en Ciencias de la Nutrición, mención Alimentos Saludables
• Magíster en Ciencias de la Nutrición, mención en Nutrición Clínica
• Magíster en Ciencias de la Nutrición, mención en Nutrición Humana
• Magíster en Nutrición y Alimentos, Mención Promoción de la Salud y Prevención de Enfermedades Crónicas Asociadas a la Nutrición

Instituto de la Comunicación e Imagen

• Magíster en Comunicación Política

Instituto de Estudios Internacionales

• Magíster en Estudios Internacionales

Instituto de Asuntos Públicos

• Magíster en Ciencia Política

Programas Interfacultades

• Magíster en Psicología Clínica de Adultos
• Magíster en Psicología, mención Psicología Clínica Infanto Juvenil
• Magíster en Estudios de Género y Cultura, con mención en Humanidades
• Magíster en Estudios de Género y Cultura, con mención en Ciencias Sociales